Вирусы следят за нами: у них нашли своего рода «глаза и уши»

Новое исследование показало, что вирусы используют информацию о состоянии среды, чтобы «решить», когда выжидать, а когда размножаться и вырываться наружу, убивая клетку-хозяина.
Бактерия Caulobacter делится, образуя стебельчатую клетку (справа) и роевую клетку со жгутиком
Бактерия Caulobacter делится, образуя стебельчатую клетку (справа) и роевую клетку со жгутиком
Общественное достояние

Новое исследование, проведенное учеными из Мэрилендского университета округа Балтимор (США), доказывает, что вирусы используют информацию из окружающей среды, чтобы «решить», когда оставаться внутри своих хозяев, а когда размножаться и вырываться наружу, убивая клетку-хозяина. Работа имеет значение для разработки противовирусных препаратов. Научная статья вышла Frontiers in Microbiolog, о ней рассказали в университете.

«Способность вируса чувствовать окружающую среду добавляет еще один уровень сложности во взаимодействие вируса и хозяина. Прямо сейчас вирусы используют эту способность в своих интересах. Но в будущем мы могли бы использовать это им во вред», — говорит Иван Эрилл, профессор биологии, старший автор новой статьи.

Новое исследование было сосредоточено на бактериофагах — вирусах, поражающих бактерии, часто называемых просто «фагами». Фаги, которых изучали в данном исследовании, могут заразить своих хозяев только тогда, когда бактериальные клетки имеют специальные придатки, пили и жгутики, которые помогают бактериям двигаться и спариваться. Бактерии производят белок под названием CtrA, он контролирует отращивание пили.

Новая статья показывает, что многие зависимые от придатков фаги имеют в своей ДНК участки, которые могут считывать присутствие белка CtrA и прикрепляться к нему. Такие участки называют сайтами связывания. Еще более удивительно, что с помощью подробного геномного анализа обнаружилось: эти сайты связывания не были уникальными для одного фага или даже одной группы. Многие различные типы вирусов имеют сайты связывания с CtrA. Всем им для заражения требовалось, чтобы у хозяев были пили и/или жгутики. Это не могло быть совпадением. То есть способность контролировать уровни CtrA изобреталась несколько раз на протяжении эволюции разными фагами, заражающими разные бактерии.

Фото: University of Maryland Baltimore County
Дельта-фаг, впервые идентифицированный в новом исследовании, он имеет сайты связывания CtrA

Еще один нюанс в этой истории: первый фаг, у которого исследовательская группа определила сайты связывания CtrA, заражает особую группу бактерий, называемую Caulobacterales. Caulobacterales существуют в двух формах: «роевая» форма, которая свободно плавает, и «стебельчатая», которая прикрепляется к поверхности. У роевиков есть пили/жгутики, а у стебельчатых нет.

Поскольку фаги могут заражать только роевые клетки, в их интересах выйти из своего хозяина только тогда, когда в зоне доступа много роевых клеток. Как правило, Caulobacterales живут в бедной питательными веществами среде и очень рассредоточены.

«Но когда они находят хороший карман для микросреды, они становятся клетками-стебельками и размножаются, в конечном итоге производя большое количество роевых клеток. Мы предполагаем, что фаги отслеживают уровни CtrA, которые повышаются и понижаются в течение жизненного цикла клеток, чтобы выяснить, когда роевая клетка становится стебельчатой и превращается в фабрику роевиков. В этот момент они разрывают клетку, потому что поблизости будет много роевиков, которых можно заразить», — говорит Эрилл.

Еще более интересными являются следствия.

«Было доказано: все, что мы знаем о фагах, каждая разработанная ими эволюционная стратегия, переносится на вирусы, заражающие растения и животных. Это почти данность. Так что, если фаги анализируют своих хозяев, вирусы, поражающие людей, обязательно будут делать то же самое», — объясняет ученый.

Например, животный вирус может «захотеть узнать», в какой ткани он находится или насколько силен иммунный ответ хозяина. Это открывает возможности для новых методов лечения.

«Если вы разрабатываете противовирусный препарат и знаете, что вирус "прислушивается" к определенному сигналу, то, возможно, вы сможете обмануть вирус. Однако пока что мы только начинаем понимать, насколько активно вирусы следят за нами и "принимают решения" на основе этого», — подчеркнул Эрилл.

Взлом с проникновением: биологи впервые сняли на видео, как вирус заражает клетку

Ученые провели первое в России массовое секвенирование ВИЧ