Новая технология позволит редактировать геном без CRISPR

Бельгийские исследователи разработали новый набор инструментов из 16 различных коротких последовательностей ДНК, которые позволяют запускать контролируемые и специфические события рекомбинации в любом геноме. Он дополняет, а в некоторых случаях и превосходит знаменитый CRISPR. Результаты представлены в двух статьях в Nature Communications.

Системы CRISPR произвели революцию в этой области, поскольку их можно очень легко нацелить на различные части генома. В новом исследовании авторы использовали другой генетический механизм: сайт-специфические рекомбиназы, которые позволяют эффективно разрезать и вставлять ДНК в определенные места генома, каждая рекомбиназа распознает только одну точную последовательность ДНК.

Они позволяют обойти некоторые проблемы CRISPR, включая нежелательные точечные мутации и структурные вариации и сложность вставки больших фрагментов ДНК. CRISPR также более дорог и сложен, как утверждается в сообщении.

«Мы можем избежать непредсказуемого способа взаимодействия нескольких участков рекомбинации в геноме друг с другом», — говорит Кевин Верстрепен, директор Центра микробиологии VIB-KULeuven.

Новый набор инструментов установили на дрожжах и протестировали на бактериальных и растительных клетках.

«Мы смогли подтвердить, что изменение экспрессии с помощью наших методов, основанных на рекомбинации, позволяет быстро и эффективно оптимизировать экспрессию генов в биосинтезе. Это не только предлагает возможности для улучшения фабрик по производству микробных клеток, но и подтверждает эффективность нашего набора инструментов для ученых и промышленности, работающих в области геномной инженерии», — говорит один из авторов исследования Шарлотта Каутрилс.