В кишечнике человека обнаружены гигантские бактерии
Далеко не все бактерии представляют собой микроскопические создания. Некоторые могут достигать сантиметра в длину — они встречаются обычно в специфических средах, таких как мангровые заросли и кишечник рыб.
Микробиологи обнаружили ДНК гигантских бактерий Epulopiscium в кишечных микробиомах людей по всему миру. Статья об этом открытии вышла в виде препринта на bioRxiv.
Обычно бактерии имеют длину около 2 микрометров, а гигантскими принято считать те, что крупнее 10 микрометров. Виды, принадлежащие к роду Epulopiscium, могут достигать 600 мкм, или 0,6 мм — и если повезло иметь хорошее зрение, их можно разглядеть невооруженным глазом.
Обычно их находят в кишечнике рыб-хирургов, но эколог-микробиолог Дэнни Ионеску из Берлинского технического университета заметил родственные Epulopiscium последовательности ДНК и у других видов рыб. Чтобы оценить распространенность бактерий, он с коллегами проанализировал последовательности ДНК, амплифицированные из более чем 600 000 микробиомов. Большинство из них были общедоступными, остальные — из образцов, собранных командой Ионеску.
Среди этих микробиомов, взятых у самых разных видов из более чем 80 стран, обнаружены «десятки тысяч положительных результатов» на Epulopiscium, говорит ученый, у животных от моллюсков до хорьков.
Epulopiscium нашли также в тысячах человеческих микробиомов. Как правило, на них приходилось лишь 1–2% идентифицированных в образце последовательностей ДНК, но в редких случаях их доля достигала 20%.
Считается, что у рыб-хирургов Epulopiscium меняют pH кишечника и активность пищеварительных ферментов. Какое влияние они могут оказывать на людей — пока неясно. Выяснилось только, что наибольшее количество этих бактерий наблюдается в первый год жизни. Кроме того, они чаще встречаются у людей с воспалительными заболеваниями кишечника.
«Вероятно, [бактериальный] организм не вызывает эти состояния, а пользуется дисбалансом в микробиоме», — предполагает исследователь.
В каждой клетке гигантских бактерий содержатся сотни или даже тысячи разных хромосом, и это огромное генетическое разнообразие помогает им процветать в нестабильных условиях. Поэтому они могут быть полезны как маркер нарушения работы кишечника еще до появления симптомов, считает Ионеску.
Объективности ради, самих гигантских бактерий в кишечнике человека ученые не видели. Только гены — а они могут принадлежать какому-нибудь родственнику Epulopiscium вполне заурядных размеров. Ионеску проводит исследования с помощью флуоресцентных зондов, предназначенных для связывания с выявленными последовательностями, чтобы обнаружить эти бактерии.
«Когда мы получим снимки, у нас будет доказательство», — заключил он.
